從1999年開始，國防科工委組織有關部門係統地論證了月球探測的科學目標，2000年，中國科學院通過了對科學目標的評審，並據此科學目標開始研製有效載荷。從2002年nian起qi，國guo防fang科ke工gong委wei組zu織zhi科ke學xue家jia和he工gong程cheng技ji術shu人ren員yuan研yan究jiu月yue球qiu探tan測ce工gong程cheng的de技ji術shu方fang案an。經jing過guo兩liang年nian多duo的de努nu力li，深shen化hua了le科ke學xue目mu標biao及ji其qi實shi施shi途tu徑jing，落luo實shi了le探tan月yue工gong程cheng的de技ji術shu方fang案an，建jian立li了le全quan國guo大da協xie作zuo的de工gong程cheng體ti係xi，提ti出chu了le立li足zu我wo國guo現xian有you能neng力li的de繞rao月yue探tan測ce工gong程cheng方fang案an。
2004年1月，國務院批準繞月探測工程立項，命名為嫦娥工程。2006年2月，國務院頒布《國家中長期科學和技術發展規劃綱要（2006～2020）》，明確將“載人航天與探月工程”列入國家十六個重大科技專項。
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